Sejalan dengan visi dan misi di atas, tujuan program studi adalah:

1. Menghasilkan lulusan yang mampu mengamalkan dan mengembangkan ilmu pengetahuan dan teknologi melalui penalaran dan penelitian dalam bidang BK, baik di sekolah maupun di luar sekolah.
2. Menghasilkan lulusan (Magister Pendidikan) yang mampu berperan sebagai konsultan profesional BKdalam setting sekolah, luar sekolah, keluarga dan masyarakat.
3. Menghasilkan pelayanan profesional BK yang bermutu tinggi untuk warga masyarakat, dalam rangka pengabdian kepada masyarakat